L’Agence a mis en place, depuis 1999, un suivi annuel des ventes d’antibiotiques vétérinaires. Ce suivi est basé sur les recommandations du chapitre 6.8 du code sanitaire pour les animaux terrestres de l’OIE 2016 « Suivi des quantités d’agents antimicrobiens utilisées chez les animaux servant à la production de denrées alimentaires et détermination des profils d’utilisation ».
En 2016, le volume total moyen des ventes est proche de 530 tonnes d’antibiotiques  et en diminution de 18,5 % par rapport à la moyenne des années 2014 et 2015.
Alors que le tonnage d’antibiotiques vendus en France était de 1311 tonnes en 1999, il se situait à 910 tonnes en 2011 année de référence pour le plan Ecoantibio. Les 530 tonnes enregistrées en 2016 correspondent à une réduction de 41,8 % par rapport à 2011.

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