Les contrôles sanitaires tout au long de la chaîne alimentaire et la surveillance des dangers sanitaires demeurent une priorité du ministère aussi bien dans le domaine végétal (lutte contre la bactérie Xylella fastidiosa, contre le capricorne asiatique, etc.), que dans le domaine animal (prévention, surveillance et lutte contre les maladies animales : l’influenza aviaire, la tuberculose bovine, la peste porcine africaine, les salmonelles, etc.) et dans le domaine de l’alimentation, à la lumière des récents épisodes sanitaires.